在短短的几个月中，2019年的小说冠状病毒已从区域病毒发展到全球大流行，但其分布并不是唯一改变的东西。病毒基因组（尤其是新型冠状病毒等RNA病毒的基因组）可以极快地积累突变，这意味着每种新感染的病毒可能在其基因组中具有细微的变化。
这些突变虽然具有挑战性，但却提供了机会。通过识别和将病毒突变与地理起源，感染性和症状的观测联系起来，我们可以更好模型病毒如何扩散以及它在给定感染中的表现。例如，人们认为，根据基因组评估，纽约的大多数冠状病毒病例来自欧洲。更重要的是，这为基于遇到的特定病毒株提供了指导治疗的潜力。
但是，许多方法（例如大多数病毒测试策略的基于的定量PCR（QPCR）技术）都不会给我们提供此信息。那我们怎么能得到它呢？
通过下一代测序的病原体的分子指纹
在过去的十年中，下一代测序（NGS）技术已经从罕见到无处不在。QPCR通过基于大小和/或数量的放大材料分析来放大DNA的“块”，而NGS方法允许直接读取DNA，核苷酸通过核苷酸（即，字母）。
然而，在分析人类样品时，发现所有人类DNA中的病毒基因组一点都像在草丛中找到针头。伦敦大学病原体基因组学部主任朱迪思·布鲁尔（Judith Breuer）教授领导的传染病研究小组，使用了一种使用病毒测序方法188bet博金宝官方网站安捷伦的监控目标富集研究技术。研究人员使用靶向人冠状病毒序列的探针进行调查面板，研究人员可以从人类样品中捕获病毒序列。
然后，研究人员可以获取其NGS序列数据，将其与已知序列（“参考序列”）进行比较，并识别病毒遗传密码中的突变，插入或缺失。这是一种非常强大的方法，布鲁尔教授作为领导该指控的研究人员之一，它率先采用了直接从临床样本中分析病原体的应用。
为研究人员提供一个新工具，以了解SARS-COV-2
在过去的十年中，布鲁尔教授不仅是病原体研究领域的宝贵贡献者，而且是对传染病研究中的SuneSelect技术的应用。利用灵活的高性能调查平台技术，我们与Breuer博士合作，发布了20多个病原体NGS面板，作为该面板的一部分188bet博金宝官方网站安捷伦社区设计计划。
为了应对19日的大流行，布鲁尔教授的小组设计了一个勘探小组，以对英国医院的突破集群进行冠状病毒测序研究。Breuer教授是英国传染病研究的主要科学家之一，成为了该公司的一部分COVID-19基因组学英国财团上个月。