如果预测可能发生共同爆发的何时以及何时发生何时发生怎么办?

不仅投射病毒的轨迹,还可以预测在何时何地期望积极病例浪潮。

铺平大流行的道路


“而且我没有抱怨。这款工具对我来说是全新的,服务和保修非常出色。我们对我们不后悔。”
- 丹尼娜·西蒙斯(Denina Simmons)

这正是丹尼娜·西蒙斯(Denina Simmons)在加拿大安大略省科技大学进行研究的。

生物学助理教授分析了来自安大略省达勒姆地区的SARS-COV2痕迹的废水样品,以确定导致COVID-19的病毒是否可以检测到,并可能预测人群中的covid spikes。她的工作的早期结果表明,在该地区报道了阳性病例中相同的峰值之前,该病毒在废水中存在峰值。

Denina谈到测试方案时说:“如果可以证明这一点,您可以将其视为预警信号。”该协议使用了安捷伦液相色谱量子级飞行器时间质谱仪(LC/Q-TOF MS)188bet博金宝官方网站测量在研究环境中表明SARS-COV2存在的丰度蛋白。

当她的部门在2019年底购买该乐器时,这并不是丹尼娜(Denina)的想法。她计划使用它来测量鱼类蛋白质和代谢物中的环境污染物水平 - 而且她几乎没有达到。新工具不在大学的预算中。

188bet博金宝官方网站Agilent的认证预先二手仪器(CPO)计划使购买成为可能。该计划从实验室购买较旧的工具来升级其设备并将其翻新以转售,这对于为客户提供了更多选择。这些优势还包括增强的产品管理和成为环保供应商。

同时,客户在不牺牲质量或支持的情况下会下价。丹尼娜(Denina)谈到大学购买预先拥有的系统的决定时说:“这完全是关于负担能力的。”该大学还购买了经过认证的预先二手气相色谱质谱仪(GC/MS),并计划使用该程序购买液态色谱三重四重四重质谱仪(LC/QQQ MS)。

但是,当乐器到达时,丹尼娜(Denina)的任务不仅仅是研究鱼蛋白。安大略理工大学的董事会成员分享了在澳大利亚进行的有关SARS-COV2的废水分析的报告,并建议教师研究人员效仿。

铺平大流行的道路
照片:由Denina Simmons提供。

丹尼娜(Denina)很快接受了挑战 - 她对此进行了扭曲。

迄今为止进行的研究集中在水中测量SARS-COV2核糖核酸(RNA)的存在上。

丹尼娜解释说:“但是我认为,如果您可以测量RNA,则应该能够测量蛋白质,因为蛋白质通常比RNA更丰富,更稳定。”

铺平大流行的道路

她的研究始于9月,分析了安大略省五个城市的废水处理中心的样品:阿贾克斯,克拉灵顿,皮克林,奥沙瓦和惠特比。

样品沉淀并离心后,其余的半固托盘分解为肽或氨基酸的小链。然后,Denina使用LC Q-TOF MS测量这些肽及其序列的质量,然后她可以将其映射到已知的基因和蛋白质序列,包括SARS-COV2病毒的序列。

她说,这很酷,因为大多数研究人员只是在寻找SARS-COV2 RNA或尖峰蛋白,即将病毒与人类细胞结合的棒状突起。可以这么说,这种测试方式增加了干草堆中的针头数量,同时有可能给公共卫生官员有时间为特定地区的Covid-19爆发做准备。但是废水分析的好处并不止于那里。

丹尼娜说:“我们看到一种或两种是人类而不是病毒的蛋白质,我们认为可能与感染有关,但仍需要进一步的研究。”她补充说,这是一种有可能延伸到Covid-19的潜力的方法,这表明可以扫描其他类型的病毒。

她说:“如果事实证明这是成功的,并且如果政府从这种情况中学到课程,我们可能会看到未来的监视变化。”

丹尼娜(Denina)通过Agilent的CPO计划说,这一切都成为可能。188bet博金宝官方网站她说:“ ​​CPO计划是我的团队能够完成这项工作的唯一原因,因为没有它,我们将无法购买我们的安捷伦(LC/Q-TOF MS)。”188bet博金宝官方网站“而且我没有抱怨。这款工具对我来说是全新的,服务和保修非常出色。我们对我们不后悔。”

相关资源: